Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snf8Q9CZ28 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snf8Q9CZ28 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms