Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prelid3bQ9CYY7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prelid3bQ9CYY7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Prelid3bQ9CYY7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prelid3bQ9CYY7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms