Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fQ9CY34 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms