Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx7Q9CY18 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms