Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CXL3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CXL3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms