Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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