Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nup37Q9CWU9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup37Q9CWU9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms