Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BccipQ9CWI3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BccipQ9CWI3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms