Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Sycp2Q9CUU3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sycp2Q9CUU3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sycp2Q9CUU3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms