Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms