Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms