Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CRW3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms