Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029F12RikQ9CRB4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms