Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc5Q9CRA8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms