Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl28Q9CR40 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl28Q9CR40 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms