Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg12Q9CQY1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms