Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccer1Q9CQL2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccer1Q9CQL2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms