Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ndufb9Q9CQJ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms