Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ergic3Q9CQE7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms