Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NepnQ9CQ76 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NepnQ9CQ76 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms