Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efcab2Q9CQ46 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Efcab2Q9CQ46 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms