Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1ip1Q9CQ20 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms