Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp3Q9CQ10 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms