Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms