Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ska1Q9CPV1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms