Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt88Q9CPR6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms