Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP6

Ndufa5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa5Q9CPP6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufa5Q9CPP6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa5Q9CPP6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms