Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt23Q99PS0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt23Q99PS0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms