Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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