Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem2Q99NH8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem2Q99NH8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms