Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Bco2Q99NF1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco2Q99NF1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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