Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims1Q99NE5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms