Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acss1Q99NB1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acss1Q99NB1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms