Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd1Q99MV1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms