Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrrtQ99MR6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms