Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms