Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b4Q99ME6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms