Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaipQ99ME3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaipQ99ME3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms