Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp1b1Q99LU0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms