Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rsl24d1Q99L28 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsl24d1Q99L28 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms