Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms