Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ciao1Q99KN2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
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