Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl22Q99JN2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl22Q99JN2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms