Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ddb2Q99J79 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddb2Q99J79 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ddb2Q99J79 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ddb2Q99J79 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ddb2Q99J79 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ddb2Q99J79 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ddb2Q99J79 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ddb2Q99J79 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddb2Q99J79 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ddb2Q99J79 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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