Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim11aQ99J19 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms