Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd1Q923L3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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