Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4bQ91ZP4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms