Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms