Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms