Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc71Q8VEG0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms